Mendiang Kiai Ng H Agus Sunyoto meninggalkan banyak sekali ”warisan” karya tulis, pemikiran, serta jejak perilaku yang patut jadi panutan. Beberapa karyanya bahkan dinilai telah merekonstruksi sejarah. Terkesan berbeda, namun dilengkapi dengan literatur yang sangat lengkap.